近日,我校金则新和李钧敏教授团队在中科院一区TOP期刊《Horticultural Plant Journal》上发表题为“Genome sequencing provides insights into Caprifoliaceae genome evolution and the mechanism underlying second blooming phenomenon in Heptacodium miconioides”的研究论文(Horticultural Plant Journal, 2023, https://doi.org/10.1016/j.hpj.2022.11.008)。金则新教授和李钧敏教授为该论文的通讯作者,李月灵博士和孙中帅博士为该文的第一作者,台州学院为该论文的第一单位。
七子花(Heptacodium miconioides Rehd.)是忍冬科(Caprifoliaceae)的落叶小乔木,我国特有单种属植物,为国家II级重点保护植物,具有重要的园艺和科研价值。该研究基于Illumina、PacBio和Hi-C测序数据,完成了染色体水平的七子花基因组组装,其大小为622.28 Mb,基因组覆盖率约为99.81%,共注释获得了32075个编码基因,组装序列挂载到14条pseudochromosomes,super-scaffold N50长度达到41.39 Mb。该研究完成了七子花染色体级别的基因组组装,为理解七子属进化过程中七子花的杂交起源问题提供参考。
Fig. 1 Characteristics of Heptacodium miconioides and its genome features
该研究对七子花不同发育时期的花萼进行转录组测序,通过转录组数据中萼片发育相关基因家族MADS-box表达模式,以及与GA激素合成相关基因的联合分析,暗示着HmAP1-、HmAP3-和HmSEP-可能是七子花萼片伸长、发育和膨大的候选基因。该研究初步阐明了其“二次开花”现象的分子机制,为其独特的系统位置和园艺价值提供了理论依据。
Fig. 2 Schematic depiction of the analysis of type II MADS-box and gibberellic acid (GA) biosynthesis genes at four sepal developmental stages
该项研究得到了国家自然科学基金(32001113)、浙江省自然科学基金(LQ19C030001; LTY22C030002)、台州学院青年英才等课题的资助