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结球白菜和拟南芥防御素基因的鉴定与比较分析
发布者:管理员 发布日期:2015-01-07 浏览次数:
作    者:蒋明,钱宝英,李金枝
影响因子:0
刊物名称:植物病理学报
出版年卷:2013, 43(4): 368-375

文章摘要:植物防御素是一类富含半胱氨酸的小分子蛋白ꎬ在抗病反应中起着重要作用ꎮ 本研究以结球白菜和拟南芥基因组序 列为材料ꎬ利用生物信息学手段进行基因鉴定、染色体定位和进化分析ꎮ 结果表明ꎬ结球白菜有11 个防御素基因成员ꎬ数 量少于拟南芥(15 个)ꎬ基因组DNA 全长183 ~ 637 bpꎬ开放阅读框全长183 ~ 363 bpꎻ除结球白菜Bra029208 序列外ꎬ其余 防御素基因均有1 个内含子ꎻ基因定位结果表明ꎬ一些基因成簇分布ꎬ推测由串联重复所致ꎬ拟南芥的3 号、结球白菜的1、 4、5 和10 号染色体均没有防御素基因的分布ꎻ进化分析结果表明ꎬ26 个防御素成员可分为三大类ꎬⅠ类有10 条序列ꎬⅡ类 13 条ꎬⅢ类最少ꎬ仅3 条ꎮ

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