作    者：蒋明，管铭，潘小翠
影响因子：0
刊物名称：核农学报
出版年卷：2013, 27(8): 1118-1124

文章摘要：CCCH锌指蛋白(Zinc finger proteins)广泛分布于动物、植物和微生物之中，在RNA代谢过程中起着重要作用，通过鉴定核盘菌和灰葡萄孢菌Zf基因，为基因克隆、表达分析和功能研究奠定基础。本研究以核盘菌和灰葡萄孢菌全基因组序列为材料，运用生物信息学的手段开展Zf基因的全基因组鉴定和分析。经分析，核盘菌和灰葡萄孢菌各有11个Zf基因，它们的开放性阅读框全长分别为663-3741bp和633-3486bp；共检测到55个CCCH锌指基序，以C-X7-C-X5-C-X3-H(22个)和C-X8-C-X5-C-X3-H(21个)最为常见，其中C-X8-C-X6-C-X3-H和C-X7-C-X6-C-X3-H为2种新发现的基序类型；进化分析结果表明，22个Zf基因聚为4组，除SS1G_13631、SS1G_09360、BC1T_00310和 BC1T_05217外，核盘菌和灰葡萄孢菌的Zf基因分别位于不同的小分支，该结果与Zf基因的基因结构、基序数量和分布情况一致。

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